Curso Introducción al análisis estadístico de los estudios de asociación de genoma completo (GWAS)

Información
Profesorado
Contenido

Dirección y coordinación académica 

Supercomputación Castilla y León (SCAYLE), Oficina Técnica.

Objetivos

El curso pretende introducir los conceptos básicos implicados en la selección de diseños experimentales y la adaptación de modelos estadísticos para la realización de estudios de asociación de genoma completo (GWAS). El curso también pretende abordar aspectos básicos de los análisis funcionales post-GWAS. Además, se pretende contextualizar a los alumnos en relación con posibles herramientas (plataformas de genotipado, software, bases de datos, etc.) que puedan ser de utilidad específica o más adecuadas para estudios que tengan como centro del estudio animales de interés agrario.

Destinatarios

El curso está dirigido a investigadores interesados en estudios genómicos, a profesionales del sector de las Ciencias Computacionales, Biología y/o Biotecnología relacionados con el diagnóstico genético y a Alumnos Universitarios (titulaciones técnicas del ámbito experimental y/o económico) de posgrado y, en general, cualquier persona afín a la temática tanto en la dimensión de la investigación, como de la innovación y el desarrollo.

Número de plazas 20

Fecha

23 al 26 de febrero de 2026.

Duración 29 horas

Horario

• Lunes a miércoles de 09:00 a 14:00 y de 15:00 a 18:00 horas.

• Jueves de 09:00 a 14:00 horas.

Lugar

Edificio CRAI – TIC, Campus de Vegazana, Universidad de León.

Idioma

Español.

Importe matrícula

Matrícula de 225€. Coste completo del curso de 450€, al que se le ha aplicado un descuento del 50% gracias a la a la Cofinanciación al 50% de la Unión Europea y el Ministerio de Industria, Comercio y Turismo y la Fundación EOI del Gobierno de España, en el marco del Mecanismo de Recuperación y Resiliencia financiado por los fondos Next Generación de la Unión Europea. No obstante, los puntos de vista y las opiniones expresadas son únicamente los del autor o autores y no reflejan necesariamente las de la Unión Europea, el Ministerio de Industria, Comercio y Turismo o la Fundación EOI. Ni la Unión Europea ni la autoridad que concede la subvención pueden ser considerados responsables de los mismos.

Nº de cuenta: ES82 2103 4292 8600 3351 0978. 

Tras la finalización del curso, SCAYLE ofrece acceso gratuito a recursos HPC a los inscritos durante el mes siguiente a la finalización del mismo, gracias a la financiación del Proyecto DIGIS3, vinculado a la cumplimentación y firma de la documentación completa asociada a los test DMA (Digital Maturity Assessment). Quedan exentas las entidades asociadas al DIGIS3.

Inscripción

El plazo de Inscripción finalizará una semana antes del comienzo del curso.

Una vez realizada la inscripción, el alumno dispone de un plazo de 7 días para realizar el ingreso de la cuota del curso y formalizar la matricula, en caso contrario la reserva será anulada.

La adjudicación de las plazas será por riguroso orden de formalización de la matrícula.

Cristina Esteban Blanco

Doctora en Ciencias veterinarias y de los alimentos por la Universidad de León (2020).

Licenciada en Bioquímica por la Universidad de Oviedo (2012).

Experiencia

Investigadora postdoctoral en el laboratorio de genetica gastrointestinal en el Centro de Investigación Cooperativa en Biociencias, CIC bioGUNE (Actualidad).

Investigadora pre y posdoctoral en el Dpto de Mejora Genética Animal en la Univesidad de León (2017-2021).

Técnico de proyecto en en Centro de Supercomputación de Castilla y León (SCAYLE) (2013-2017).

Pablo Augusto de Souza Fonseca

Científico titular en el Instituto de Ganadería de Montaña/Consejo Superior de Investigaciones Científicas (IGM/CSIC) desde el 2024, donde participa en un proyecto de investigación relacionado con el desarrollo de herramientas estadísticas y computacionales para la integración de datos multiómicos en el contexto de estudios de nutrigenómica en rumiantes. En 2025, participó en el desarrollo de un algoritmo de aprendizaje automático para la modelización de curvas de lactancia como investigador visitante en la Universidad de Purdue. Anteriormente, fue investigador postdoctoral en la Universidad de León (España) en el Departamento de Producción Animal (2022-2024). Este puesto está financiado por NextGeneration-EU a través de las becas María Zambrano para atraer talento internacional. Ocupó el primer puesto entre los candidatos de su área de investigación. Participó en el desarrollo de herramientas bioinformáticas y estadísticas para integrar datos de metiloma, transcriptoma y genoma con el fin de identificar posibles biomarcadores asociados a los rasgos de producción, la eficiencia alimentaria y la resiliencia en ovejas lecheras. Obtuve mi licenciatura en Biología en la Universidad Federal de Minas Gerais (Brasil). Posteriormente, completé su doctorado y máster en Genética, con especialización en Genómica y Bioinformática, en la misma universidad, donde recibió el premio a la mejor tesis doctoral del departamento de Genética. En su doctorado, investigó los mecanismos genéticos asociados con la ineficiencia reproductiva en ganado bovino macho y hembra y su correlación con los rasgos de producción, aplicando diferentes procesos para integrar información multiómica. Durante su estancia de doctorado y periodo posdoctoral en la Universidad de Guelph (UofG), amplió con éxito sus conocimientos sobre las herramientas bioinformáticas desarrolladas para integrar información multiómica utilizando enfoques de biología de sistemas para investigar la base genética de rasgos complejos como la mortalidad fetal, la terneza de la carne, la eficiencia alimentaria y la mastitis en el ganado vacuno de carne y leche. En la UofG, tuvo la oportunidad de trabajar con varias especies y fenotipos de ganado, lo que le permitió contribuir de manera significativa a proyectos de investigación globales (y a gran escala) como «Food from Thought», «Dairy and Beef cluster» y «The Efficient Dairy Genome Project». La naturaleza multidisciplinar de su trayectoria académica y disposición a participar en actividades docentes y de asesoramiento le ayudaron enormemente a mejorar sus habilidades interpersonales, incluida la tutoría de estudiantes (dos estudiantes universitarios como asesor principal y un estudiante de máster como coasesor). También desarrolló e impartió cursos en los campos de la genética, la bioinformática, la genética cuantitativa, la genética de poblaciones, la cría de animales y la estadística (unas 450 horas lectivas).

Las sesiones tendrán lugar del 23 al 26 de febrero de 2026. (Lunes a miércoles de 09:00 a 14:00 y de 15:00 a 18:00 horas, jueves de  09:00 14:00 horas)

23 de febrero de 2026 – Introducción y Herramientas Computacionales. Cristina Esteban Blanco.

Recepción de Alumnos y Entrega de Documentación.

Inauguración del Curso.

Sesión 1/ 09:00 – 14:00 (20 minutos de descanso)
09:00 – 11:00 Introducción al entorno Linux.

11:00 – 11:20 Pausa.

11:20 – 14:00 Introducción al entorno Linux y R (si hiciera falta).

14:00 – 15:00
Descanso para la comida.
Sesión 2/ 15:00 – 18:00
15:00 – 18:00 Uso de Caléndula para la gestión de datos genómicos (Clase 1).

24 de febrero de 2026 – Fundamentos y Modelos Estadísticos. Pablo Augusto de Souza Fonseca y Cristina Esteban Blanco.

Sesión 1/ 09:00 – 14:00 (20 minutos de descanso)
09:00 – 11:00 Conceptos de genética de poblaciones y estudios de asociación genética. Pablo Augusto de Souza Fonseca.

11:00 – 11:20 Pausa.

11:20 – 14:00 Fundamentos teóricos sobre GWAS y análisis estadísticos. Cristina Esteban Blanco.

14:00 – 15:00
Descanso para la comida.
Sesión 2/ 15:00 – 18:00
15:00 – 18:00 Plataformas de genotipado, control de calidad e imputación. Cristina Esteban Blanco y Pablo Augusto de Souza Fonseca.

25 de febrero de 2026 – Análisis de asociación y Prácticas GWAS. Pablo Augusto de Souza Fonseca.

Sesión 1/ 09:00 – 14:00 (20 minutos de descanso)
09:00 – 11:00 Análisis de asociación y estructura de poblaciones.

11:00 – 11:20 Pausa.

11:20 – 14:00 Imputación.

14:00 – 15:00
Descanso para la comida.
Sesión 2/ 15:00 – 18:00
15:00 – 18:00 Práctica de GWAS.

26 de febrero de 2026 – Análisis Post-GWAS. Pablo Augusto de Souza Fonseca.

Sesión 1/ 09:00 – 14:00 (20 minutos de descanso)
09:00 – 11:00 Análisis post-GWAS (Meta-análisis) – Identificación de candidatos funcionales y mapeo fino.

11:00 – 11:20 Pausa.

11:20 – 14:00 Práctica de análisis post-GWAS.