FastQC

FastQC tiene como objetivo proporcionar una forma sencilla de realizar algunas comprobaciones de control de calidad de los datos de secuencia en bruto procedentes de tuberías de secuenciamiento de alto rendimiento. Proporciona un conjunto modular de análisis que puede utilizar para dar una rápida impresión de si sus datos tienen algún problema del que debería estar al tanto antes de realizar cualquier otro análisis.

Las principales funciones del FastQC son:

• Importación de datos desde archivos BAM, SAM o FastQ (cualquier variante).
• Proporcionar una rápida visión general para decirle en qué áreas puede haber problemas.
• Gráficos y tablas de resumen para evaluar rápidamente sus datos.
• Exportación de resultados a un informe permanente basado en HTML.
• Operación offline para permitir la generación automática de informes sin necesidad de ejecutar la aplicación interactiva.