Plink es un conjunto de herramientas gratuitas y de código abierto para el análisis de la asociación del genoma completo, diseñado para realizar una serie de análisis básicos a gran escala de una manera eficiente desde el punto de vista computacional.
El enfoque de PLINK se centra puramente en el análisis de datos de genotipo/fenotipo, por lo que no hay apoyo para los pasos previos a éste (por ejemplo, diseño y planificación del estudio, generación de genotipo o llamadas a la CNV a partir de datos en bruto). Mediante la integración con gPLINK y Haploview, existe cierto apoyo para la posterior visualización, anotación y almacenamiento de los resultados.