RSEM

RSEM es un paquete de software para estimar los niveles de expresión de genes e isoformas a partir de los datos del RNA-Seq. El paquete RSEM proporciona una interfaz fácil de usar, soporta hilos para el cálculo paralelo del algoritmo EM, datos de lectura de extremo simple y extremo parejo, puntuaciones de calidad, lecturas de longitud variable y estimación de RSPD.