QIIME 2 es un paquete de análisis de microbiomas potente, extensible y descentralizado, centrado en la transparencia de los datos y el análisis. El QIIME 2 permite a los investigadores comenzar un análisis con datos de secuencias de ADN en bruto y terminar con cifras de calidad de publicación y resultados estadísticos.
Características principales:
Seguimiento integrado y automático de la procedencia de los datos.
Sistema de tipo semántico.
Sistema de plugin para ampliar la funcionalidad del análisis de los microbiomas.
Soporte para múltiples tipos de interfaces de usuario (por ejemplo, API, línea de comandos, gráfica).